El museo es una iniciativa de la Sociedad de Cirugía de Bogotá para la exposición de objetos en la sede del hospital de San José. Cuenta con alrededor de 300 piezas relacionadas a la ciencia médica en Colombia. Estas colecciones incluyen objetos
relacionados con el avance de diversas áreas como medicina interna, cirugía, ginecología, obstetricia, anestesiología farmacia, enfermería e instrumentación.